Новости генетики по истории

Лев Агни

Active member
Мать знаменитого Отци, альпийского "ледяного человека", чья мумия была найдена в Тироле в конце 20 века, принадлежала к небольшой и замкнутой популяции жителей Альп, полностью вымершей в наше время, заявляют ученые в статье, опубликованной в журнале Scientific Reports.

"Ледяной человек" был найден в Альпах на границе Италии и Австрии в 1991 году. Первоначально считалось, что это погибший альпинист, однако затем выяснилось, что мумифицированному телу более 5 тысяч лет — останки Отци были датированы периодом с 3365 года по 3118 год до нашей эры. "Ледяной человек" погиб от стрелы, попавшей в плечо.

Группа ученых под руководством Альберта Цинка (Albert Zink) из Института мумий и ледяного человека в городе Больцано (Италия) начала восстановление генома Отци в середине лета 2010 года, и представила первые результаты его изучения почти четыре года назад.

Ученые выяснили, что Отци болел клещевым боррелиозом, нашли его ближайших родственников по отцовской линии – жителей Сардинии и побережья Тирренского моря, а также обнаружили, что он был предрасположен к инфаркту и не мог пить молоко, так как у него отсутствовал ген переносимости лактозы.

Как отмечают Цинк и его коллеги в своей новой статье, оставалась еще одна крупная тайна – кем была его мать, и существуют ли ее потомки на Земле сегодня. Для раскрытия этой тайны ученые восстановили митохондриальную ДНК – генетический код, содержащийся в митохондриях, "энергостанциях" клетки, передающихся от матери к ребенку вместе с яйцеклеткой, и сопоставили ее с аналогичными частями генома современных и древних европейцев.

В общей сложности генетики проанализировали свыше тысячи геномов, относящихся к гаплогруппе К1, к которой предположительно принадлежит Отци, что позволило им с достаточной точностью определить то, есть ли потомки матери "ледяного человека" сегодня в Европе и понять, где она жила.

Как показал этот анализ, Отци и его родственники по материнской линии были коренными жителями Тирольских Альп, которые жили в небольшой и замкнутой популяции, не покидавшей гор и не смешивавшейся с другими жителями Центральной Европы. Все ее представители вымерли до сегодняшнего дня.

Представители этих альпийских "горцев", как показывают расчеты Цинка и его коллег, попали на территорию самых высоких гор Европы около 5,3 тысяч лет назад, примерно через три тысячи лет после того, как предтечи отца Отци – фермеры-носители гаплогруппы G2a – мигрировали из Ближнего Востока в Европу. Последующие "переселения народов" в Бронзовом веке, по всей видимости, послужили одной из причин вымирания этой замкнутой популяции, заключают ученые.

РИА Новости http://ria.ru/science/20160114/1359557395.html#ixzz3xDHt7lbS
 
Версия о том, что Отци погиб от стрелы, подвергается вполне заслуженному сомнению...
И всё таки, "с" Ближнего Востока, а не "из". Кроме того, "последующие переселения" были уже, по-видимому и ИМХО, в "веке железном", а не "бронзовом".
 

Лев Агни

Active member
А.Чистяков - 15/1/2016 15:22

Версия о том, что Отци погиб от стрелы, подвергается вполне заслуженному сомнению...
И всё таки, "с" Ближнего Востока, а не "из". Кроме того, "последующие переселения" были уже, по-видимому и ИМХО, в "веке железном", а не "бронзовом".

Вот даже помочь ничем смогу. Но не уловил разницы между "с" и "из" Ближнего Востока. Примерно, как в обиходе "с Европы" и "из Европы" - вроде бы одно и тоже. (?)
 

Лев Агни

Active member
Ученые: чума присутствовала в Европе четыре века после "черной смерти"



Восстановленный геном возбудителя чумы, вызвавшего эпидемию этой болезни в Марселе в 1722 году, показал, что средневековая бактерия, вызвавшая "черную смерть" в середине 14 века, не вымерла после ее окончания и просуществовала в Европе как минимум еще четыре века, говорится в статье, опубликованной в журнале eLife.

"Нас крайне пугает мысль о том, что чума могла прятаться буквально где-то за углом по всей Европе, обитая внутри каких-то нам неизвестных носителей этой болезни. Будущие эксперименты и раскопки могут помочь нам понять, кто или какой вид животных выступал их носителем, где они обитали и почему они исчезли", — заявил Йоханнес Краузе (Johannes Krause) из Института истории человека в Йене (Германия).

Краузе и его коллеги являются "первооткрывателями" средневековой чумной палочки – четыре года назад им удалось извлечь обрывки ДНК патогена из жертв "черной смерти" в Лондоне, восстановить его геном и показать, что эта бактерия исчезла бесследно и сегодня больше не существует.

В своей новой работе они показали, что средневековый штамм Yersinia pestis исчез не так быстро, как они считали ранее, проведя аналогичные эксперименты с костями жертв чумы, эпидемия которой захлестнула Марсель в 1720-22 годах, во времена Людовика XV.

Эта эпидемия была последней крупной вспышкой чумы в Европе – она унесла свыше 100 тысяч жизней и вызвала достаточно сильный экономический упадок в регионе, который продолжался примерно 7-8 лет. Благодаря жестким мерам, в том числе и постройке "чумной стены" вокруг Марселя и его окрестностей, распространение болезни удалось избежать.

Группа Краузе извлекла генетический материал Yersinia pestis из двух десятков зубов людей, погибших от чумы в Марселе, и использовала его для воскрешения ДНК этого микроба. Точность восстановления на этот раз была несколько выше, чем у ДНК "черной смерти", и каждый фрагмент генома марсельской чумной палочки удалось прочитать по 12 раз.

Сравнив ее ДНК с тем, как устроены гены у современных и средневековых разновидностей Yersinia pestis, авторы статьи с удивлением обнаружили, что чума из Марселя была почти идентична по своему генетическому строению бацилле "черной смерти", а не более современным штаммам этого микроба.


Это означает, что средневековая Yersinia pestis, вопреки представлениям ученых, каким-то образом смогла выжить, прячась среди популяций диких или домашних животных, и периодически "выходить из подполья", вызывая эпидемии, подобные марсельской.

Пока ученые не готовы говорить о том, где чума могла прятаться, и как она могла попасть в Прованс и Марсель. Традиционно считалось, что эпидемия 1720-22 годов была вызвана крысами с корабля Гран-Сен-Антуан, прибывшим в Марсель из Леванта. Открытие Краузе и его коллег говорит, что чума могла быть завезена не обязательно из Ливана: ее могла вызвать и "местная" бактерия, предположительных носителей которых еще предстоит найти, заключают генетики.

РИА Новости http://ria.ru/science/20160124/1363505670.html#ixzz3yCaF47Sn
 

Лев Агни

Active member
Анализ "воскрешенной" ДНК нескольких популяций древних индейцев показал, что прибытие европейцев и болезней Старого Света действительно было причиной резкого сокращения в численности популяций "первых народов" Америки, говорится в статье, опубликованной в журнале Science Advances.

"Удивительно, но ни один из изученных нами геномов, которые мы нашли в останках свыше ста древних индейцев, не оставил своих следов в ДНК современных аборигенов Америки. Единственный сценарий, который соответствует этим наблюдениям – полное исчезновение изолированных друг от друга популяций индейцев после того, как они начали контактировать с европейцами", — заявил Бастиен Лламас (Bastien Llamas) из университета Аделаиды (Австралия).

Лламас и его коллеги пришли к такому выводу и в очередной раз обвинили испанских конкистадоров и других европейских завоевателей и путешественников в геноциде индейцев после того, как восстановили обрывки ДНК, извлеченные из почти ста инкских мумий и костей представителей других племен аборигенов Америки.

Ученых интересовала так называемая митохондриальная ДНК – небольшой сегмент генома, который содержится в митохондриях, энергостанциях клетки, и который передается, вместе с этими органеллами, от матери к ребенку. Сегодня генетики и историки используют мтДНК для составления "родословных" различных народов и наблюдений за их миграциями и историями.

Используя обрывки митохондриального генома, группа Лламаса смогла проследить за тем, как мигрировали различные группы индейцев в период почти с момента их появления в Америке, примерно 16 тысяч лет назад, и до начала современной эры истории.

Сравнение мтДНК показало, что предки индейцев практически не контактировали друг с другом после изначального расселения по Новому Свету, разбившись на изолированные группы около 8-9 тысяч лет назад. В таком виде они просуществовали до начала Нового времени, когда фактически все древние гаплогруппы митохондриальной ДНК полностью исчезли.

Подобный ход событий, учитывая то, что все образцы ДНК происходят из густо заселенных районов Северной и Южной Америки, говорит о том, что их носители массово перестали существовать, убитые или болезнями, или насильственным путем.

Так как подобные "вымирания" гаплогрупп мтДНК произошли примерно в то же время, когда в Америку проникли конкистадоры, можно говорить, как считает Лламас, что вина европейцев в резком сокращении популяции индейцев и полном исчезновении ряда племен является

РИА Новости http://ria.ru/science/20160403/1401116132.html#ixzz44of5PXRx
 

Лев Агни

Active member
Средневековая эпидемия чумы, уничтожившая треть населения Европы, не исчезла бесследно в середине 14 века – этот штамм микроба был "реэкспортирован" Европой назад в Россию, Поволжье и Азию через 10 лет после завершения эпидемии, заявили генетики, выступавшие на ежегодной встрече Общества американских археологов.

"Наше открытие помогло нам нащупать своеобразные генетические бусы, которые тянутся из западной Европы 14 века во все регионы мира и все последующие эпохи. Эта нить сначала протянулась в Россию, а затем за ее пределы – большая часть эпидемий чумы, случившихся после 14 века, могла быть вызвана потомками европейских бацилл "черной смерти", — заявил Йоханнес Краузе (Johannes Krause) из Института истории человека в Йене (Германия).

Краузе, известный "некромант"-палеогенетик, и его коллеги уже несколько лет работают над восстановлением истории крупнейшей в истории Европы эпидемии – так называемой "черной смерти", вызванной чумной палочкой, Yersinia pestis. В 2011 году группа Краузе восстановила геном этой бациллы, а чуть позже – нашла мутации, превратившие безобидную почвенную бактерию в "бич божий" 14 века.

Относительно недавно, в феврале 2016 года, Краузе и его коллеги совершили крайне неожиданное открытие – изучая кости жертв вспышки чумы в Марселе в 18 веке, они обнаружили, что эпидемия была вызвана тем же самым штаммом Yersinia pestis, который вызвал "черную смерть". Это стало крайне большой неожиданностью ученых, так как они считали, что эта разновидность микроба исчезла, уступив место менее заразным и смертоносным штаммам чумной палочки.

Пытаясь понять, как это могло произойти, команда Краузе приступила к поискам следов чумы в разных уголках Европы и Азии, изучая отложения тех эпох, которые соседствовали с великой эпидемией середины 14 века.

Ответ на этот вопрос был найден, парадоксальным образом, в России, на территории Поволжья, в одной из могил в развалинах Булгара – одного из крупных городов Волжской Булгарии и Казанского Ханства. Здесь ученые нашли останки человека, предположительно погибшего от чумы в периоде между 1360 и 1400 годами.

Восстановив и изучив ДНК чумной палочки из его останков, Краузе и его коллеги с удивлением обнаружили, что ее геном напоминает по своей структуре то, как устроена ДНК бацилл "черной смерти" из Лондона, более поздних версий Yersinia pestis из Испании и микроба, вызвавшего вспышку болезни в Китае в 19 веке.

Как один и тот же штамм Yersinia pestis мог попасть в разные уголки мира в столь разные эпохи? Возможно, предполагают ученые, что они были "реэкспортированы" из Европы, двигаясь вместе с товарами тем же путем, по которому они попали на территорию Запада в середине 14 века из Азии.

Если это действительно было так, то можно говорить о том, что чума времен "черной смерти" не исчезла, и что она умела распространяться на впечатляющие расстояния с достаточно высокой для микробов скоростью. Как надеется Краузе, его команде и другим ученым удастся выделить в "воскрешенной" ДНК средневековой Yersinia pestis те гены, которые помогали этому микробу одновременно быть чрезвычайно заразным и при этом эффективно распространять себя.

РИА Новости http://ria.ru/science/20160427/1421387074.html#ixzz476j6N2K6
 

Лев Агни

Active member
Анализ обрывков ДНК из костей жителя легендарного Карфагена показал, что некоторые обитатели этого торгового города были европейцами, а не африканцами и семитами, заявляют ученые в статье, опубликованной в журнале PLoS One.

"Гаплогруппа U5b2c1 считается одной из самых древних подтипов митохондриальной ДНК в Европе, она ассоциируется с популяциями первых европейских охотников-собирателей. Она крайне редка сегодня – ее носителями является всего 1% жителей субконтинента. Что интересно, наше исследование показало, что с генетической точки зрения карфагенянин Арихэ ближе всего к современным жителям Португалии", — заявила Лиза Матису-Смит (Lisa Matisoo-Smith) из университета Отаго (Новая Зеландия).

Матису-Смит и ее коллеги изучали останки одного из самых известных жителей древнего Карфагена, так называемого "юноши из Бирсы", или "Арихэ". Этот относительно молодой человек жил в столице пунического царства примерно в 6 веке до нашей эры, у стен которой его останки были захоронены в пышном мавзолее. Высокая сохранность его костей и убранство усыпальницы давно привлекают внимание историков, изучающих историю этого финикийского государства.

Матису-Смит и ее коллеги попытались выяснить, к какой категории народов принадлежали карфагеняне, используя обрывки генетического материала Арихэ, которые сохранились в его останках. Ученым удалось извлечь и восстановить так называемую митохондриальную ДНК – небольшую часть генома, которая хранится в митохондриях, "энергостанциях" клетки, и передается от матери к ребенку.

Как объясняют ученые, историки сегодня считают, что карфагеняне с генетической точки зрения были по большей части африканцами, предками которых были жители древнего Туниса и колонисты из Финикии, на чьей территории сегодня располагается Ливан и сопредельные с ним государства.

Анализ, проведенный авторами статьи, показал необычные результаты – оказалось, что Арихэ принадлежал к "европейской" гаплогруппе U5b2c1, чьи представители сегодня не встречаются ни на территории Туниса, ни в Ливане. Это означает, что многие или даже все карфагеняне, скорее всего, были европейцами, а не африканцами.

Объяснение этому удивительному факту может крыться в том, где сегодня обитают носители этой гаплогруппе – на территории Иберийского полуострова, в Португалии и Испании. Дело в том, что во времена античности юго-восточное побережье будущей Испании было колонизировано финикийцами. Местные колонии достаточно быстро стали независимыми и попали под контроль Карфагена, одного из крупнейших торговых узлов того времени.

Как считают Матису-Смит, последние представители гаплогруппы U5b2c1, проигравшие в конкурентной борьбе с первыми земледельцами Европы, могли жить на территории Иберии и прилежащих островов, где они вступили в контакт с финикийцами, которых интересовал контроль над местными торговыми путями. Подобные контакты могут объяснять то, почему Арихэ и его предки были европейцами, а не африканцами.

"Мы мало чего знаем о финикийцах — все, что о них известно, мы подчерпнули из греческих и римских хроник, авторы которых вряд ли объективно относились к своим "вечным" врагам. Мы надеемся, что наше открытие и другие проекты по изучению Карфагена помогут нам выяснить, откуда взялся этто народ и как их культура сказалась на развитии цивилизации", — заключает генетик.

РИА Новости http://ria.ru/science/20160525/1439459327.html#ixzz49juPtGfa
 

anguci

Member
1 человек это мало для выводов. мало ли кого занесло в карфаген.
 

Лев Агни

Active member
Понлостью http://генофонд.рф/?page_id=8904

Текст исследования http://mbe.oxfordjournals.org/content/early/2016/03/17/molbev.msw055.short?rss=1

Авторы приходят к важному выводу относительно природы европейского компонента в южносибирских популяциях. Поскольку он относится к раннему времени, то не может быть результатом смешения генофонда с русскими, как считали ранее. Этот гораздо более ранний слой смешения может быть связан с распространением степняков ямной культуры на Алтай и Саяны в бронзовом веке.

Наконец, при помощи LD анализа авторы показали, что популяции Южной Сибири прошли через бутылочное горлышко среднего размера (по сравнению с узким бутылочным горлышком, через которое прошли азиатские популяции, и широким – соответственно, европейские).

Один конкретный результат касается происхождения бурят – хотя они говорят на языке монгольской группы, но генетически не родственны монголам. Скорее всего, предки бурят жили в районе озера Байкал, а впоследствии контактировали с монгольскими популяциями и переняли их язык.

Итак, вот основные выводы, к которым приходят авторы статьи.

По-видимому, в течение Последнего ледникового максимума происходила депопуляция Сибири с последующей радикальной сменой популяций. Хотя, возможно, в Южной Сибири небольшие группы людей пережили ПЛМ в рефугиумах (климатических убежищах), а позднее распространились по региону.

Географическое положение определяет около 48% генетического разнообразия популяций Сибири, а остальное сформировалось под влиянием демографических событий, в частности миграций на большие расстояния.

Результаты работы согласуются с данными недавних исследований, которые указывают на обширную миграцию в двух направлениях из евразийских степей в бронзовом веке (Allentoft et al. 2015; Haak et al. 2015). Эта степная миграция, полагают авторы, сыграла значительную роль в формировании генофонда популяций Сибири.

Новый метод — анализ AHG – в сочетании с анализом ADMIXTURE позволяет реконструировать последовательность эпизодов смешения (генетических потоков) в истории популяций, а метод WT позволяет датировать эти эпизоды.

Наиболее интенсивное генетическое смешение имело место в Южной Сибири, из которой ведут происхождение некоторые популяции Центральной и Северной Сибири. Так, якуты имеют явные признаки происхождения из области близ Байкала и разделяют общих предков с бурятами. Селькупы и ненцы также имеют признаки южного происхождения и, возможно, разделяют общих предков с тувинцами. Наоборот, народы, говорящие на тунгусских языках, вероятно, происходят не из байкальского региона, как считали ранее, но из амурского региона. Некоторые из недавних экспансий из Южной Сибири связаны с развитием скотоводства, особенно с одомашниванием северного оленя.

По-видимому, европейский предковый компонент в популяциях Южной, Центральной и Северной Сибири — это не результат завоевания Сибири Россией и последующего смешения с русскими, как можно было ожидать. Европейский компонент оказался гораздо более древним, скорее всего, он был принесен степной миграцией на Алтай и Саяны в бронзовом веке.

В конце статьи авторы приводят схему с обобщением своих результатов по путям формирования генофонда популяций Сибири. Разными цветами обозначены предковые компоненты разного происхождения. К сожалению, картинка не сопровождается детальным объяснением в подписи.
 

anguci

Member
не очень ясно как они ареалы предковые очерчивали, на каком основании
 

anguci

Member
да чепуха это. пишут что выборка из исконно казачьих станиц. но олег балановский должен знать, что в 20-х годах 20-го века подавляющую часть казаков перебили, а их место заняли т.н. "иногородние", т.е. переселенцы из центральных губерний, чей генофонд он в итоге и исследовал.

а так то, по идее если бы такое исследование до 20-х гг. производилось, то уловили бы не только ногайцев, но и калмыков и разных кавказцев, да вообще думаю еще немало кого...
 
В погребениях, вестимо.
Но вообще если не исследование, то публикация некорректна. "Верхнедонские" - это до куда вниз по Дону?

PS А еще эта светлая полоса хорошо совпадает с маршрутом, которым донские казаки любили ходить на богомолье в Соловки. Учитывая достаточную узость полосы - может, гены распространялись в противоположном направлении? ;)
 

Лев Агни

Active member
Неужели всех покойников сжигали? :)

Просто нужна эксгумация с каких-то старых кладбищ или известных старинных захоронений, а это лишняя бюрократия и всякие сторонние фичи, напрямую не относящиеся с генетическим исследованиям...ведь новые кладбища на местах старых располагаются, как говорится, с подселением.
 
Многие казачьи городки, существовавшие на XVII - начало XVIII века, ныне не существуют. Кладбища при них, надо полагать, были...
 

Лев Агни

Active member
Halgar Fenrirsson - 16/7/2016 15:18

Многие казачьи городки, существовавшие на XVII - начало XVIII века, ныне не существуют. Кладбища при них, надо полагать, были...

Т.е., получается, самый широкий комплекс работ от поиска документов, где что располагалось, до начала раскопок с подъемом всего вся.
 

anguci

Member
даже кладбища 20 века не все сохранились (не только для казаков), т.к. часто бывало что с уходом (убийством) населения все забывалось и просто исчезало. слышал про случаи когда банально перепахивали их под колхозные поля.
 
Top